一、臭氧消毒作為氯消毒的替代方法，水處理中被越來越多地應用。試驗表明，臭氧幾乎對所有細菌、病毒、真菌及原蟲、卵囊都具有明顯的滅活效果。缺點是：投資大，費用較氯化消毒高；水中O3不穩定，控制和檢測O3需一定的技術；
臭氧代替氯消毒的好處：
（1）臭氧具有極強的殺菌性及滅活病毒的作用，可有效防止傳染性疾病的蔓延，實驗證明，同樣濃度的臭氧殺滅細菌和病毒的效果是氯的600-3000倍。
（2）臭氧是國際公認的環保型綠色殺菌劑，不會對環境造成任何二次污染。而氯制劑會與水中的有機物反應生成多種氯化有機化合物，如三氯甲烷、氯仿等，這些物質均為公認的致癌突變物。
（3）從水中蒸發出來的氯代化合物及氯氣等有毒氣體，聚集在水池上方不易散去，損害人的呼吸器官，嚴重影響人們的身體健康，而使用臭氧則不會產生此問題。
（4）臭氧是強氧化劑，可有效分解水中的腐殖質，氧化水中的鐵、錳離子，分解水中散射光線的微小有機體，從而大大提高水的清澈度，使水呈現出美麗的藍色，而氯制劑則無此效果。
二、海洋館、水族館水消毒的主要方面：
（1）水體消毒
臭氧在水處理中的主要用途是消毒。在水消毒估算臭氧投放量時，必須考慮所要求的消毒程度、進水類型和水質穩定性。經過預處理去除水中主要耗氧因素，如亞硝酸鹽、色度、懸浮物以后，臭氧投量可減少90%。臭氧可增加生物有機體細胞的通透性，使細胞內物質外流而失活，破壞細胞內酶系統或進入細胞內破壞其核酸化學性質，因此能滅菌和消毒。
（2）臭氧對赤潮的解毒作用
赤潮的危害是由赤潮生物的有害物質或有害代謝產物引起的。赤潮生物大量繁殖可導致水體缺氧。赤潮生物產生的有毒代謝物使水質惡化，這對海產生物幼體的生存十分不利。在海水魚蝦育苗中，因赤潮而引起苗種大量死亡的事故時有發生。有報道采用添加化學物質的方法，然而在海水養殖設施內用這種方法來控制赤潮并不是很理想。外國有人研究出臭氧對赤潮毒素也有滅活作用。用臭氧處理發生過赤潮的海水，再供水族館、海水養殖場，是一條安全有效的途徑。
（3）改善水質和預防水生動物疾病
臭氧能夠改善水質，對預防水生動物疾病有較好的效果。在閉路循環養殖水體中，運行中的主要問題有有毒物質的積累，特別是氨氮和亞硝酸鹽。當這種水循環系統生物負載增加，浮床的硝化作用不完全，**在24小時內發酵分解便可達有毒程度。但引入臭氧后，閉路海水系統在24小時內相對穩定，氨氮和亞硝酸鹽的積累明顯下降。
（4）貝類凈化
在法國和美國等國家。用臭氧凈化貝類已成為商業國模，被污染的杜蠣經臭氧處理后得到了凈化；臭氧可在48小時內有效地去除污染的大腸菌類。我國的海、淡水貝類資源相當豐富，但由于近海沿岸水體污染，導致資源利用受到限制。如，食用被污染過的毛蚶攜帶甲肝病毒的情況進行研究，探討臭氧對毛蚶體內甲肝病毒的殺滅機制，用臭氧凈化毛蚶有可能是一條可取之路。關于臭氧凈化貝類的實用性研究，有待進一步研究。
臭氧發生器是國際公認的環保型綠色殺菌設備，不會對環境造成任何二次污染。使用臭氧發生器，可大大降低水處理工藝的管理及操作難度，同時臭氧發生器具有很高的安全性，而氯制劑在運輸、儲藏、使用時具有一定的危險性。
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